6 espèces sont inscrites à l'annexe II de la directive (espèce dont la conservation nécessite la désignation de zones spéciales de conservation) et à l'annexe IV de la directive « Habitats, faune, flore » (espèce nécessitant une protection stricte).

Trois espèces de chauves-souris

•  Grand murin (Myotis myotis) (code 1324) http://inpn.mnhn.fr/docs/cahab/fiches/1324.pdf ,
•  Grand rhinolophe (Rhinolophus ferrum-equinum) (code 1304) http://inpn.mnhn.fr/docs/cahab/fiches/1304.pdf ,
•  Vespertilion à oreilles échancrées (Myotis emarginatus) (code 1321) http://inpn.mnhn.fr/docs/cahab/fiches/1321.pdf,

Trois espèces d’invertébrés

•  le Damier de la Succise (Euphydryas aurinia) (code 1065)

http://inpn.mnhn.fr/docs/cahab/fiches/1065.pdf  : l’adulte ne vit que le temps de se reproduire, entre une à deux semaines. Il n’a pas été revu depuis 2005 sur les coteaux de la vallée de l’Eure.

•  l'écaille chinée (Euplagia quadripunctaria) (code 1078) http://inpn.mnhn.fr/docs/cahab/fiches/1078.pdf : espèce prioritaire qui vole de juin à août.

•  Le lucane cerf-volant (Lucanus cervus) (code 1083) http://inpn.mnhn.fr/docs/cahab/fiches/1083.pdf : est le plus gros coléoptère d'Europe, les mâles peuvent mesurer jusqu'à 8,5 cm. Il dépose ses œufs dans de vieilles souches ou des arbres feuillus dépérissants et les larves consomment le bois mort.

Par ailleurs, d’autres espèces importantes de flore et de faune ont été répertoriées sur le site. Parmi les 677 espèces de flore répertoriées, 180 présentent un intérêt patrimonial.